Eu usei o Windows Live Mesh porque é automático. O Unison também é uma solução muito boa, mas seria necessário um pouco de script (pelo que entendi) para que ele fosse executado automaticamente no Windows.
Embora o Live Mesh ainda não tenha suporte ao Linux (eu posso viver sem ele, acho), e as sincronizações parecem um pouco lentas, não exigem uma sincronização com a nuvem e oferecem a opção de desktop remoto baseado em navegador. / p>
Eu gostaria que fosse lançado um programa que atendesse facilmente a esses requisitos. Espero que isto ajude. Obrigado a todos pela contribuição.