O tamanho e a posição da janela dependem completamente do programa; alguns programas mudam a posição, alguns nem sequer podem redimensionar, e alguns escolhem o seu sistema operacional padrão. Para salvar um tamanho / posição maior da janela do Explorer, abra o Windows Explorer, ajuste como quiser e mantenha pressionada a tecla Ctrl-Shift enquanto clica no X vermelho (canto superior direito) para fechá-lo. Isso lembrará do tamanho / posição da próxima vez que você abrir o Explorer.
Programas como Word e Wordperfect lembrarão a última posição e tamanho que você escolheu para a janela de navegação, somente para esse programa.
E alguns programas exigem que você abra um arquivo depois de redimensionar / reposicionar a janela, para lembrar as alterações feitas.