Eu também tive o mesmo problema. Eu tenho um Macbook Pro com OS X Lion. Também atualizei meu mac com a atualização 2012-006 e ele quebrou os applets Java no Google Chrome.
Depois de pesquisar bastante, fiquei sabendo que o Chrome é um navegador de 32 bits e não suporta o Java 7 de 64 bits da Oracle e não havia como executar applets no Google Chrome em um Mac até chegarmos uma versão de 64 bits do Chrome para o mac.
Então, fui para a Mac App Store > Compras e baixei o OS X Lion e instalei-o no meu disco existente. Note que parece um grande problema, mas correu bem para mim e seus dados e configurações não são apagados / redefinidos. O antigo Apple JRE 6 de 32 bits é instalado e até que o Google Chrome 64-bit seja lançado, você pode continuar usando-o sem problemas, desde que você não reinstale a atualização 2012-006.
Funcionou para mim, então deve funcionar para você também. Eu não tenho certeza se você tem Leão ou Leão da Montanha, mas eu acho que o mesmo truque deve funcionar para o Leão da Montanha também.