Gabinetes típicos de unidades USB suportam, historicamente, apenas 1,5 TB de capacidade. Eu tenho um pressentimento de que isso tem algo a ver com a natureza de 32 bits do recinto, mas eu poderia estar totalmente fora disso. Certifique-se de que as especificações do gabinete indiquem que ele suporta unidades maiores que 1,5 ou 2 TB.
Até agora, eu só vi gabinetes USB 3 (SuperSpeed) suportando qualquer coisa maior que 3 TB.
Editar (de comentários): Se você estiver preocupado com o fato de o Windows estar armazenando algo em cache na unidade, tente corrigi-lo em outra máquina ou acesse-o usando um CD ao vivo, como GParted .