Você pode usar Ctrl e as teclas de seta, com ou sem Shift pressionado, para navegar pela planilha rapidamente. Ctrl + teclas de seta pula diretamente para a "última" célula naquela direção que tem conteúdo. Manter pressionada a tecla Shift seleciona as células conforme você se movimenta. Dependendo de como sua planilha está organizada, você também pode usar Ctrl + Home (pula para o canto superior esquerdo da planilha) e Ctrl + End (pula para o canto inferior direito da planilha), novamente com ou sem Mudança para selecionar.
Como você mencionou A1 e B1, presumo que seu alcance se estenda da parte superior da planilha e de 5.000 linhas para baixo.
A maneira mais fácil, então, é ir para A1 (Ctrl + Home fará o truque), depois pressionar Ctrl + para baixo, o que o levará ao A5000 ou por aí. Mova-se para a coluna C na última linha, segure a tecla Shift e pressione Ctrl + para cima. Você deve terminar em C1 com o intervalo de C1 a C5000 selecionado, com o foco de entrada permanecendo no C5000.
Como alternativa à navegação e seleção acima, conforme sugerido por Jon em um comentário, você pode pressionar Ctrl + G e, em seguida, insira um intervalo como A1:A5000
.
Agora insira a fórmula como normal, para a linha destacada para entrada. No seu caso, provavelmente seria =A5000-B5000
. Quando terminar, pressione Ctrl + Enter em vez de Enter para aceitar. O Excel preencherá automaticamente todas as outras células no intervalo selecionado, ajustando as referências de célula conforme necessário.
Como menção de bônus, o LibreOffice Calc tem o mesmo recurso, mas usa Alt + Enter em vez de Ctrl + Enter (pelo menos no Linux).
Nenhum mouse é necessário!