Você já pensou em usar o Total Commander ? É um pouco diferente do Windows Explorer, mas você pode usá-lo totalmente com um teclado, sua interface é totalmente personalizável (esquema de cores, tamanho da fonte, tipo e cor), você tem uma espécie de prompt de comando, você pode criar pastas apenas pressionando F7, você pode visualizar arquivos com F3 (existem plugins para o Total Commander que permitem abrir quase todos os tipos de arquivos que você possa precisar, de fotos a músicas).
Você também pode usá-lo com uma estrutura de árvore para pastas, semelhante ao Explorer. Eu uso diariamente no trabalho, e isso me poupa de muitas viagens para o mouse:)