Eu ainda não descobri por que o Thunderbird faz o que ele faz (embora o comentário de jason C pareça provável), mas eu consegui fazê-lo funcionar.
Eu simplesmente parei o Thunderbird, deletei o arquivo mimeTypes.rdf
do diretório do perfil e reiniciei o Thunderbird. Em seguida, ele solicitou que o navegador fosse usado e eu consegui alterá-lo para o Chromium com êxito.
O Thunderbird criou um novo arquivo mimeTypes.rdf
que faz referência ao cromo.
Agora, procura um novo cliente de e-mail que não seja totalmente absurdo, mas isso é uma postagem para outro site ...