Eu acredito que este é o comportamento pretendido. O gerenciador de exibição (neste caso, lightdm) cria e gerencia a sessão login / x. Ao reiniciar o gerenciador de exibição, você mata a sessão x e a sessão atualmente conectada e deve efetuar login novamente e estabelecer uma nova sessão.
Alguém mais bem informado me corrija se eu estiver errado, mas acredito que este é o caso.