Encontrou esta pergunta no Stack Overflow. O OP oferece algumas possibilidades:
By editing /etc/dbus-1/system.d/skype.conf or /etc/dbus-1/system.conf
By adding new entry in the gconf (but skype isn't listed there)
By adding a Skype public api (but then users should not be able to remove it)
Infelizmente, a possibilidade de usar um cliente alternativo para o Skype compatível com esse recurso não está mais disponível, já que a Microsoft enlatou o SkypeKit.