Com base no comentário do Engineer Toast (e ampliado com algumas capturas de tela das respectivas ferramentas):
People have made tools for exactly this. Google "document vba project"
Here's one that costs money: Aivosto (Project Analyzer Enterprise Edition)
Here's one that doesn't: contextures.com/ExcelTemplates/ExcelVBACodeDoc.zip (direct link)
Captura de tela do Project Analyzer
capturadeteladoExcelVBACodeDoc
(Eu acho que isso não é exatamente o que você queria, pois não cria nenhum diagrama, mas sim uma lista de procedimentos)