Você precisa se certificar de que qualquer dispositivo que acesse o disco rígido possa ler o sistema de arquivos NTFS.
Com o Windows, não é um problema, pois todas as versões do XP em diante podem.
A pergunta então é que o PS3 pode acessar uma unidade NTFS? A julgar pelo primeiro link (reconhecidamente de 2007) que surgiu de uma pesquisa por "PS3 NTFS "Eu diria que não.