O disco rígido pode ser visto como uma longa seqüência de bits e bytes. A maneira como o disco rígido pode ser usado como uma opção para armazenar pastas e arquivos é usando um sistema de arquivos.
A maioria dos sistemas de arquivos usa blocos para armazenar arquivos. Cada arquivo consiste em um ou mais blocos. Assim, um arquivo leva pelo menos o tamanho de um bloco, no seu caso 4 kilobyte (que é um pequeno bloco).
Isso tudo é altamente dependente de qual sistema de arquivos você usa, mas esta é provavelmente a explicação.