Você pode querer dar uma olhada no Emacs W32 . Tem algumas boas personalizações para o Windows.
Quanto a ter o tema de cores funcionando ... Eu não tentarei converter coisas para sua instalação atual, parece que algumas coisas estão por aí (o arquivo deve ser apenas .emacs - não User.emacs, mesmo para .emacs. d diretório). Em vez disso, vou apenas dizer-lhe como tenho as coisas configuradas, não deve ser muito difícil de traduzir, se você quiser manter sua configuração atual.
Acho mais fácil criar apenas um diretório C: \ home e definir uma variável de ambiente HOME para apontar para esse diretório. Coloque seu arquivo .emacs lá. Um diretório .emacs.d será criado. Eu também gosto de criar um diretório chamado emacs_site_lisp na pasta inicial; C: \ home \ emacs_site_lisp. Eu coloco qualquer e todos os pacotes ou arquivos sob lá para fácil referência.
Coloque o diretório color-theme na pasta emacs_site_lisp.
Então no meu .emacs eu tenho:
(setq load-path (append load-path (list "~/emacs_site_lisp")))
(setq load-path (append load-path (list "~/emacs_site_lisp/color-theme-6.6.0")))
(require 'color-theme)
(color-theme-hober)
Note que ~ referencia seu diretório inicial se não estiver familiarizado com * nix.
Isso deve funcionar como um mínimo .emacs - é provável que você tenha muito mais coisas aí assim que tentar diferentes coisas & ajustar configurações diferentes, muitos exemplos de e-mails a serem encontrados ... basta pesquisar no google: filetype: emacs
Boa sorte.