Isso é um bug. Eu experimentei o problema também. Aqui está um relatório de bug sobre o problema: link
Se eu usar o menu no canto superior direito e dizer desligar, o computador vai para a tela de logout, onde eu tenho que clicar no canto inferior direito e dizer para desligar novamente.
do terminal, se eu disser sudo poweroff, ele faz o que eu esperaria. Qual é o problema com isso?