Não deve haver um problema.
Os drivers têm a capacidade de causar sérios danos ao seu computador ... Basicamente, qualquer coisa que eles quiserem é carregada no Windows em um nível muito mais baixo.
Basicamente, se você pode imaginar software sendo alto, se o software quebrar - é apenas uma questão de terminá-lo, onde, como se um driver falhasse, ele poderia derrubar a máquina inteira.
A Microsoft oferece muitos testes no WHQL (Windows Hardware Quality Labs) e basicamente significa que eles garantem isso vai funcionar e não travar nada - basicamente, qualquer coisa que tenha o logotipo é compatível com qualquer outra coisa que tenha o logotipo.
Não há nada de errado em usar dispositivos certificados que não sejam de logotipo, mas o aviso é simplesmente o modo de dizer da Microsoft: não nos procure se quebrar!