Infelizmente, o Outlook 2010 não parece ter esse recurso. Responder a uma mensagem marca-a como lida.
No entanto, se eu puder sugerir uma abordagem alternativa para o seu problema: considere a solução de ter algo em sua caixa de entrada "não processado" e, em seguida, usando pastas para o que você tratou. Os e-mails concluídos não devem estar na sua visualização da caixa de entrada. Você é claramente um usuário avançado de e-mail, talvez você possa ter alguma tranquilidade ao não confiar no Outlook para marcar e-mails em negrito e não?
Para resolver sua outra preocupação: Se você estiver na sua caixa de entrada e clicar no botão "De", receberá um agrupamento simples de e-mails. Dessa forma, você poderia facilmente passar por "todo o trabalho que precisa ser feito para um determinado cliente". Você também pode pesquisar, mas somente na sua caixa de entrada , para o mesmo efeito.