Você pode usar a opção -copythreshold
. No sinalizador de ajuda uníssono:
-copythreshold n use copyprog on files bigger than this (if >=0, in Kb)
Você pode criar um programa / script fictício que não faça nada. Normalmente eu acredito que você especificaria o rsync com opções especiais como o copyprog, mas se você não quer copiar nada, o copyprog não deve tomar nenhuma ação.