Você pode usar o Evernote no Ubuntu com o Everpad.
Everpad is an Evernote tool that integrates extremely well with Unity. It implements a Unity Lens which automatically searches Evernote notes through the Dash.1
Para instalar, basta pressionar Ctrl + Alt + T no seu teclado para abrir o Terminal. Quando se abre, execute os comandos abaixo:
sudo add-apt-repository ppa:nvbn-rm/ppa
sudo apt-get update && sudo apt-get install everpad
Caso contrário, você pode instalar o Wine , que permite que você execute aplicativos do Windows.
1 Fonte: Everpad