- Abra a caixa de diálogo Criar novo console (a tecla de atalho Win Shift w pode ser alterada em Configurações > Chaves )
- Clique com o botão direito do mouse na caixa de diálogo Criar novo console ou pressione Alt Espaço .
- Item de menu > Redefinir o histórico de comandos ...
Como alternativa, você pode editar o histórico manualmente no registro (HKCU \ Software \ ConEmu \ «NomeCongrado» \ CmdLineHistory) ou em ConEmu.xml, o que você usar.
PS. uau, nova tag