Ambos os programas que você mencionou já fazem isso. No entanto, depois de carregar o arquivo em outro lugar, você não poderá impedir que o servidor remova a arte do álbum novamente, se assim for.
Além disso, as tags ID3 são uma fera mimada, e pode ser que o servidor não reconheça o formato específico que você está tentando usar:
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Experimente diferentes formatos de imagem - JPEG vs. PNG;
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Use o iTunes ou foobar2000 para converter as tags ID3 entre diferentes versões (por exemplo, o iTunes escreve ID3v2.4, mas algumas ferramentas suportam apenas v2.3);
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Use mp3Diags para garantir que as tags ID3 não estejam corrompidas ( embora note que às vezes dá falsos positivos para v2.4).