A opção mais fácil seria apenas alterar o atalho do menu de ajuda:
Vocêpodeusaro
<autogen>__KeyToKey__ KeyCode::KEY_7, VK_SHIFT | VK_COMMAND, KeyCode::MINUS, ModifierFlag::SHIFT_L, ModifierFlag::COMMAND_L</autogen>
Você também pode configurar atalhos usando um script de shell como este:
defaults write -g NSUserKeyEquivalents '{
"Comment Selection" = "@-"; // cmd-minus
"Toggle Comment" = "@-";
}'
No TextMate, os atalhos para os itens do pacote têm precedência.