Você analisou o MediaMonkey ?
Acabei de converter um mp3 para ogg (como eu sabia que tinha mp3 com metadados) e os metadados (título, artista, gênero, álbum, ano, número da faixa) foram copiados. Eu também o converti de volta para mp3 e os metadados também são preservados dessa maneira.
Também fará conversões em lote. Basta adicionar seus arquivos ogg à biblioteca, selecioná-los todos e, em seguida, Ferramentas > Converter formato de áudio funciona em todos os itens selecionados. Recentemente, descobri que você não precisa adicionar as faixas à sua biblioteca. O navegador embutido do Media Monkey pode ver os arquivos diretamente.
Ele vem com um codificador de mp3 limitado por tempo (30 dias se eu me lembrar), mas você pode substituí-lo por um ilimitado simplesmente atualizando a dll.