Você pode criar um link para a outra pasta
ln -s /home/primary/webapps/application /home/secondary/application
Isso criará um link em /home/secondary
chamado "aplicativo", que aponta para /home/primary/webapps/application
. Uma vez logado em sua pasta pessoal, ele simplesmente precisa clicar na pasta "application" e será direcionado para o local apropriado.