Você terá que editar os arquivos de configuração do ALSA para conseguir isso, o que infelizmente envolve uma quantidade significativa de magia negra.
Veja um exemplo tirado de o wiki da ALSA mostrando como dividir as saídas estéreo frontais e traseiras de um cartão em dois canais de áudio independentes dispositivos:
pcm.dshare { type dmix ipc_key 2048 slave { pcm "hw:0" rate 44100 period_time 0 period_size 1024 buffer_size 8192 channels 4 } bindings { 0 0 1 1 2 2 3 3 } } pcm.frontx { type plug slave { pcm "dshare" channels 4 } ttable.0.0 1 ttable.1.1 1 } pcm.rearx { type plug slave { pcm "dshare" channels 4 } ttable.0.2 1 ttable.1.3 1 }