É suposto fazer isso. A abordagem do Windows 8 para a área de trabalho parece ser tratá-la como uma atividade como um aplicativo nativo do Metro. Então, quando você clica na área de trabalho em seus monitores secundários, você muda para a atividade da área de trabalho, escondendo o menu metro.
Na prática, trato o menu metropolitano como o menu inicial. Se eu precisar de um aplicativo, pressione a tecla Iniciar, digite o nome do aplicativo desejado e pressione Enter. Eu presumo que aplicativos de metrô como o Explorer provavelmente tenham esse problema de comutação de desktop. A única coisa que você pode fazer é encaixar um aplicativo do metrô na lateral de uma tela, deixando a área de trabalho no restante da tela e em todas as outras.
Em resumo, os aplicativos do metrô não são compatíveis com vários monitores. Basta usar o menu metropolitano para alternar / iniciar tarefas e ignorá-lo para todo o resto.