Desculpe por uma resposta negativa, mas não acredito que o que você está pedindo seja possível.
A lista completa de opções de linha de comando para o Thunderbird está contida no artigo da MozillaZine de Argumentos da linha de comando - Thunderbird . Isso inclui uma maneira limitada de compor mensagens, mas nenhuma opção para consultar e-mails sem invocar a interface da GUI.
Qualquer solução de checagem de e-mail envolveria configurar outro cliente de e-mail orientado a terminal para fazer interface com o servidor de e-mail (sem usar o Thunderbird). Mas se você recuperar qualquer mensagem por meio de um cliente desse tipo, este e-mail poderá estar faltando quando você consultar sua conta com o Thunderbird posteriormente.
Se você deseja ler mensagens de uma caixa de correio existente, este tópico oferece algumas soluções que podem ser aplicadas no Linux:
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mutt -f mailbox - configurar um servidor imap, criar links simbólicos em ~ / mail para apontar aos arquivos usados pelo thunderbird, então use um cliente compatível com imap para ler esses e-mails.