Eu tive quase o mesmo problema na semana passada! Eu achei que era o touchpad - também afetando qualquer mouse conectado.
O que mais me incomodou foi que "apenas algumas partes da interface do usuário" eram clicáveis. E apenas às vezes e em todos os sistemas operacionais.
Portanto, descobri que era uma falha de hardware no touchpad, fazendo com que ele enviasse aleatoriamente a ação "a tecla da esquerda está sendo pressionada" para o sistema operacional. Isso torna tudo e, às vezes, apenas partes da interface não clicáveis. Isso também bagunçou qualquer outro mouse que eu conectei ao computador, já que o sinal ainda era enviado aleatoriamente.
Você está em um laptop? Seu touchpad também pode estar quebrado? Se assim for, você pode tentar desativar o touchpad quebrado através da linha de comando:
xinput list
Você receberá uma saída assim:
bolli@HAL:~$ xinput list
⎡ Virtual core pointer id=2 [master pointer (3)]
⎜ ↳ Virtual core XTEST pointer id=4 [slave pointer (2)]
⎜ ↳ SynPS/2 Synaptics TouchPad id=11 [slave pointer (2)]
⎜ ↳ TPPS/2 IBM TrackPoint id=13 [slave pointer (2)]
⎣ Virtual core keyboard id=3 [master keyboard (2)]
↳ Virtual core XTEST keyboard id=5 [slave keyboard (3)]
↳ Power Button id=6 [slave keyboard (3)]
↳ Video Bus id=7 [slave keyboard (3)]
↳ Sleep Button id=8 [slave keyboard (3)]
↳ Integrated Camera id=9 [slave keyboard (3)]
↳ AT Translated Set 2 keyboard id=10 [slave keyboard (3)]
↳ ThinkPad Extra Buttons id=12 [slave keyboard (3)]
Agora, encontre o id do seu touchpad ou qualquer coisa que possa causar isso e desative-o com este comando:
xinput set-prop 11 "Device Enabled" 0
Nesse caso, 11
é o meu ID do touchpad encontrado na lista acima. 0
significa desativar - você pode alterar isso para 1
no mesmo comando para ativá-lo novamente.
É apenas um palpite, pode valer a pena tentar.