O que você gostaria de fazer neste caso é uma Codificação em lote em todos os seus arquivos que você precisa para ajustar o volume, exceto recodificá-los todos com o mesmo formato e configurações que eram originalmente - mas altere o porção de áudio da codificação. A maioria dos softwares deve permitir que você faça isso; O Adobe Media Encoder CS6 permite definir um ganho / volume de áudio fixo para os vídeos que você está codificando e, durante a codificação, o áudio de cada vídeo será normalizado para esse nível. Tenho certeza de que muitos outros softwares possuem esse recurso de software como o Handbrake ou o Apple Compresser.