Para uso do daemon puro em um servidor sem cabeçalho, o rtorrent seria o cliente para o qual eu iria. É linha de comando e muito recurso completo, embora não seja a coisa mais fácil de configurar sendo puramente linha de comando. Existem inúmeras interfaces web para o rtorrent também, embora, novamente, não pareçam ser muito fáceis de configurar.
Para clientes GUI, prefiro qBittorrent porque funciona muito bem e tem uma boa interface. Também tem uma interface web, embora eu não a use atualmente.
O dilúvio é bom, mas quando eu estava usando ele há 2-3 anos eu descobri que ele iria parar constantemente e o desempenho era significativamente menor do que outros clientes. Eu não posso dizer se isso é verdade hoje, no entanto.
A transmissão funciona muito bem, mas sempre me pareceu muito básica.
Minhas experiências pessoais com os desenvolvedores e administradores nos fóruns do uTorrent (eu os achei insultuosos, desbocados, condescendentes, arrogantes e auto-intitulados) levaram-me a evitar completamente o programa. Eu não recomendo mais em nenhuma plataforma, independentemente de quão maduro seja o uTorrent. De fato, eu costumo recomendar qualquer outra coisa .