Se existir, você poderá usar a versão portátil de um aplicativo, normalmente usada para a chave usb. Há alguns deles aqui
Você também pode instalar o aplicativo em ambas as extremidades e, em seguida, criar um link simbólico na caixa de depósito, apontando para a pasta de configuração, se tudo que você deseja é mantê-los em sincronia.
no entanto, isso pode ou não ficar bem para o dropbox se você tiver muita leitura e gravação em seus arquivos de configuração ou bancos de dados. Além disso, usar o aplicativo em dois computadores na mesma caixa de depósito ao mesmo tempo provavelmente resultará em estragos.