O site de suporte da Acer declara que o Acer Veriton 3900Pro é compatível com o Vista, mas não com o Windows 7.
Isso não significa que o Windows 7 não funcionará neste modelo, mas apenas que talvez as opções de exibição mais avançadas (como Aero) talvez não estejam totalmente disponíveis.
No caso de um problema, onde o Windows 7 não consegue instalar o melhor driver para um dispositivo, você pode sempre instalar os drivers do Vista, já que eles são totalmente compatíveis com o Windows 7.
Em conclusão: Isso deve funcionar, mas sempre há aquela área cinza causada pelo fato de a Acer não suportar o Windows 7 para esse modelo. Eu sugeriria entrar em contato com o suporte deles para perguntar por quê. O Windows 7 funcionará, mas é melhor estar preparado para alguns aborrecimentos.
Eu sugeriria tirar uma imagem de disco da unidade do sistema antes de instalar o Windows 7, para ter uma rota de escape fácil para o Vista.