Com base nas respostas de Larry e user193782, descobri que isso funcionava para o LXDE no Debian estável (wheezy):
$ su
$ cd /etc/X11/Xsession.d
$ vi 99-synclient
O arquivo 99-synclient deve conter:
#! /bin/sh
synclient TapButton1=1
Em seguida, crie o executável 99-synclient:
$ chmod 555 99-synclient