Você pode tentar adicionar configuração de registro para o Excel.
- inicie o regedit
- vá para
HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Office.0\Excel\Options
(12.0 para o Excel 2007, se você tiver uma versão mais antiga do Excel, ela será diferente, 11.0 para 2003, 10.0 para 2002 ...) - adicione um valor de dword chamado
AlwaysSaveToCurrentPath
e defina como 0
Isso deve fazer "Salvar como" usar a mesma pasta em que o arquivo foi aberto. Se você definir o valor como 1, ele usará a pasta Padrão ao usar "Salvar como"