Apenas comentando a resposta já fornecida (os comentários não podem ser estilizados).
Isso faz parte da impressão de ajuda do cipher.exe
Displays or alters the encryption of directories [files] on NTFS partitions.
CIPHER /W:directory
/W Removes data from available unused disk space on the entire
volume. If this option is chosen, all other options are ignored.
The directory specified can be anywhere in a local volume. If it
is a mount point or points to a directory in another volume, the
data on that volume will be removed.
É verdade que somente o sistema de arquivos NTFS pode ser "cifrado"?
O que dizer do formato FAT32 que é usado ultimamente para compatibilidade com UEFI?
Parece melhor usar utilitários especiais para limpar.