Existe uma ferramenta de linha de comando do Windows bastante semelhante ao apt-get:
Você pode tentar WuInstall (para instalar atualizações, a ferramenta é gratuita) em combinação com o psexec para atualizar remotamente as máquinas, veja link
psexec \server -c -s -u domain\administrator -p password \share\path_to_wuinstall\WUInstall.exe /install