Eu encontrei a solução para minha pergunta. Você pode atribuir uma ação para cada chave dentro da seção xkb_symbols. O redirecionamento é uma ação de que precisamos:
key <AC07> { [ j, J, plusminus, NoSymbol, NoSymbol ],
type[Group1]="EIGHT_LEVEL_SEMIALPHABETIC",
actions = [ NoAction(), NoAction(), NoAction(), NoAction(),
Redirect(key=<RTRN>, clearmods=all) ]
};
Usando essa ação, você pode limpar os modificadores existentes ou adicionar novos.