Sim, você pode! Apenas certifique-se de estar executando a versão mais próxima dos seus programas em ambos, para que os arquivos de configuração em ~ / .here não confundam um ao outro.
Se o amd64 e o i386 forem instalações diferentes, você também poderá compartilhar o swap e o tmp.
Você também pode compartilhar / var / log, mas eu não recomendaria.