Não sei ao certo o que está causando o problema, mas ele não parece ser um daemon ausente. Tentei carregar tudo em /System/Library/LaunchDaemons exceto com.apple.WindowServer.plist e ele ainda falhou da mesma maneira. Ele ainda falha apenas em executar diskutil , que normalmente apenas imprime um resumo de uso. Além disso, "Killed: 9" sugere que ele não está travando a si mesmo, mas outra coisa ( launchd ?) Está acabando com ele.
De qualquer forma, há uma boa notícia: diskutil repairpermissions é realmente apenas um front-end para o programa repair_packages , e parece funcionar bem no modo de usuário único (mesmo sem nenhum daemon carregado):
/usr/libexec/repair_packages --repair --standard-pkgs
A formatação de discos provavelmente será mais difícil. Talvez seja necessário analisar usando gpt , newfs_hfs e afins.