Não é tão fácil, mas é possível, se você usa o linux.
No Linux, você pode configurar vários servidores X para serem executados simultaneamente. (veja link )
Eu realmente não sei se a aceleração de hardware é possível para vários servidores X. Depende dos drivers da sua placa gráfica.
Você também pode tentar definir drivers de placa gráfica separados para cada servidor X no arquivo de configuração. Isso deve funcionar porque você tem uma placa gfx da Intel e da NVIDIA.