Bem, não posso dar nenhuma explicação técnica, mas sei que tenho alguns flash drives que são inicializáveis e funcionam e outros que não são (usando as mesmas técnicas). Então eu acho que a resposta é:
Não, eles nem sempre são inicializáveis .
Não tenho certeza se existe alguma maneira de saber se uma unidade flash é inicializável diferente de testá-la.