Esta página tem uma lista fantástica de explicações e soluções. Eu nem vou tentar resumir aqui.
Muitas vezes, quando eu inicio o meu WinXP SP3 (atualizado ao máximo), alguns ícones no systray estão faltando. O gerenciador de tarefas mostra que o software ao qual esses ícones pertencem está em execução. Reiniciar o explorador (matando através do Gerenciador de Tarefas e, em seguida, executando novamente) traz todos os ícones de volta. Os ícones desaparecendo são praticamente aleatórios. Às vezes, até o ícone Volume desaparece.
Alguém já teve algo assim e há alguma solução para isso?
(Resposta preventiva - não, desativei a ocultação do ícone inativo)