O Windows 8 tem vários novos recursos incompatíveis com o Truecrypt - o recurso chamado Boot Seguro, principalmente; e possivelmente a nova inicialização híbrida do Windows 8. Portanto, a criptografia completa da unidade do sistema não é suportada pelo Truecrypt ( link ).
Com o Windows 8 Secure Boot habilitado (por padrão, em hardware suportado), o Truecrypt nunca funcionará (o objetivo do Secure Boot é impedir a modificação do bootloader ou o "seqüestro"). Verifique se você tem habilitar a Inicialização Segura primeiro ( link ).
Eu consideraria usar a criptografia do Windows 8 Bitlocker no lugar do Truecrypt neste momento, já que usar o Truecrypt com o Windows 8 deve ser considerado instável e um "hack" na melhor das hipóteses.