Se você usa o RAID de software do Windows, ele provavelmente ficará visível apenas para o Windows e causará problemas a longo prazo.
Se eu fosse você, procure por drivers RAID para a sua placa-mãe e configure-os através do hardware - este é de longe o melhor tipo de RAID que você pode fazer.
No que diz respeito ao seu sistema operacional, ele está sendo executado em um disco rígido regular e não tem conhecimento do RAID que está acontecendo no nível do hardware (exceto se você tiver um driver / programa inteligente que o alerta - mas ainda assim ele deve funcionar da mesma forma que um disco rígido comum).
Você pode instalar vários sistemas operacionais ou fazer praticamente qualquer coisa que puder com um disco rígido comum e é muito mais simples a longo prazo. (A instalação pode exigir um driver adicional - provavelmente você pode encontrar no fabricante da placa-mãe).
O hardware RAID tem muitos benefícios (geralmente), incluindo ser mais rápido / mais confiável, maior compatibilidade e, às vezes, reconstrução a quente (embora alguns RAIDs de software também suportem isso).
Ao mesmo tempo, lembre-se da regra golder - RAID NÃO É BACKUP. Quando você considera quantos discos rígidos você vai usar para o desastre de um a dois anos, você pode ser muito melhor simplesmente comprar uma pilha de CDs ou um NAS / assinando para armazenamento externo e fazer backups regulares.