Estou surpreso que você não possa fazer isso com o VirtualDub - vou dar uma olhada depois.
Eu tenho uma versão antiga do Premiere Elements que certamente pode fazer isso, mas é provavelmente um exagero para o que você precisa - por exemplo, suporta muitas transições. Ele também é um pouco lento e re-codifica o vídeo quando não deveria - alguns editores de vídeo podem reempacotar os dados de vídeo sem decodificá-los completamente e recodificá-los em alguns casos, acelerando drasticamente as coisas.
Você pode dar uma olhada aqui: link
E particularmente no Kino: link
Eu não usei isso, eu tenho medo. É provavelmente um exagero para o que você precisa, mas as chances são de que não será muito difícil encontrar apenas os recursos que você precisa.
Pessoalmente, uso uma mistura ad-hoc de ferramentas para fazer trabalhos semelhantes aos que você descreve. Eu uso uma versão verdadeiramente antiga do Autor do TMPeg DVD para a edição mais básica. Isso só aceita arquivos MPEG 2 e VOB prontos para DVD (o que significa que é rápido - não decodifica e recodifica).
Quando não quero a saída como um DVD, eu uso Join Arquivos VOB para, assim, juntar os arquivos VOB para um vídeo em particular, onde ele excede 1GB, e eu uso o utilitário de linha de comando ffmpeg para a gravação.
O ffmpeg deve ser capaz de unir vários arquivos, incluindo arquivos VOB, mas eu sempre tenho arquivos corrompidos como resultado. O JoinVOBFiles dá a menos arquivos corrompidos - problemas de timecode que são consertados quando a saída é recodificada.
O ffmpeg também pode cortar seções de um arquivo de vídeo, mas não há interface gráfica para selecionar os intervalos desejados.
O TMPegEnc DVD Author e o JoinVOBFiles funcionam tão rápido que o fator limitante é a velocidade do disco rígido. Eles trabalham muito mais rápido se os vídeos de entrada estiverem em um disco rígido físico diferente da saída, para que não haja "surra" das cabeças do disco rígido.
O ffmpeg é assustador - muitas opções, muitas difíceis de decifrar - mas não é muito difícil lidar com o básico. Quando você faz algo funcionar, faça anotações para não ter que descobrir de novo e está tudo bem. Eu geralmente acabo com algo como ...
ffmpeg -i inputfile.xxx -acodec libmp3lame -vcodec libxvid -qscale 8 outputfile.avi
O Nero incluiu um editor de vídeo tecnicamente mais poderoso e flexível que o TMPeg DVD Author por algum tempo, mas (1) é difícil convencê-lo a fazer essa otimização sem re-codificação, e (2) o usuário interface não funciona muito bem para mim - os controles são complicados demais etc.
TMPegEnc DVD Author pode ser muito mais poderoso hoje em dia - eu comprei há quase 10 anos.
Essa é uma mistura confusa, e eu preferiria ter uma solução de programa único que funcionasse tão bem e tão rapidamente quanto a minha combinação usual de três programas, mas eu parei de gastar tempo com isso há alguns anos.
Se eu precisar de sofisticação, eu tenho o Premiere Elements. Principalmente, o tempo economizado pela coisa de mixagem complicada com o DVD Author, por exemplo, supera os aborrecimentos. O Nero está tecnicamente em algum lugar no meio, e de alguma forma consegue nunca ser a solução certa para mim, embora seja provavelmente mais fácil para muitas pessoas do que eu fazer se você não se importar em ser um pouco lento e a interface do usuário ser um pouco fiddly.
Oh - O Windows XP inclui um "Movie Maker" e o Windows 7 inclui um "Criador de DVD". Eu também não tentei, mas meu palpite é que eles estão em um nível semelhante ao da abordagem Nero. Quando eu comprei DVD Author, eu ainda estava usando o Windows 98 e 2000 - XP não foi lançado até 2003 IIRC.