Você pode usar drives RAID independentemente da configuração do BIOS usando utilitários como o MD RAID do Linux ou o Dynamic Disk do Windows. Provavelmente, o Windows não estava inicializando quando você foi movido do AHCI para o RAID, porque isso é traduzido para o Windows como uma alteração de hardware, com a qual ele normalmente não funciona bem.
A configuração do modo RAID no BIOS realmente permitirá apenas um utilitário de configuração RAID de tempo de inicialização fornecido pelo fabricante da placa-mãe. Se um não for fornecido, configurá-lo para RAID mais não terá efeito real.