Vou contradizer completamente as outras respostas postadas até agora, já que não acredito que dividir dados / apps / SO entre diferentes partições seja realmente benéfico.
Se você tem uma boa estratégia de backup (você faz backups, não é?), então não há necessidade. O Windows 7 (e o mesmo se aplica a outras versões do Windows, Mac OS X ou Linux), fornece uma estrutura de diretórios para dados do usuário que é perfeitamente adequada para armazenar todas as suas músicas, vídeos, documentos de escritório, etc. segurança (ou seja, você pode manter seus dados privados de outros usuários), mas você também pode compartilhar dados entre outros usuários, se preferir.
Como as outras respostas dizem, talvez você tenha que reinstalar as janelas, de vez em quando, porque elas ficam em forma de pêra, mas se isso acontecer, por que não restaurar apenas do seu backup mais recente? Você afirma que está executando o Windows 7 e, se estiver usando as ferramentas nativas de backup, o backup incluirá o sistema operacional, os aplicativos e os dados. Então, uma restauração cuidará de tudo.
Eu não ficaria feliz em reinstalar o Windows em um disco que contivesse dados de que eu gostasse, mesmo se os dados estivessem em outra partição, e o que dizer que, se o seu SO for adaptado, por exemplo, seus dados podem ser confiáveis. Se você sofre uma infecção por vírus ou um sistema comprometido, então você pode realmente confiar em seus dados e apenas reinstalar o sistema operacional?
A outra desvantagem de dividir partições entre dados, aplicativos e sistema operacional é que você precisa adivinhar qual tamanho será alocado para cada um. Quando se enche e os outros estão vazios, você irá se arrepender de fazer isso.
Pelo contrário, no entanto, se você estiver procurando por um desempenho excelente, eu instalaria o sistema operacional em um disco SSD rápido e manteria meus dados em um disco convencional mais barato, no entanto você sugeriu em um comentário que você tem um laptop, isso provavelmente não é uma opção para você.