Estou assumindo que você está falando sobre a execução deste disco rígido em um sistema operacional Windows, se esse for o caso, então o @KCotreau está certo, não há benefícios de desempenho. Se você fosse executá-lo sob um sistema operacional * nix, poderia haver mais de uma seleção quanto ao tipo de arquivo que funcionaria melhor em qual sistema de arquivos, ou possivelmente a diferença entre LVM e partições nativas.
Pessoalmente, tenho a configuração das minhas unidades de rede como todas as localizações diferentes, uma unidade "Music", uma drive "Videos", etc ... Acho que isto ajuda-me a manter-me mais organizado, pois sou forçado a escolher uma unidade digite em vez de apenas soltá-lo na raiz da unidade e esquecê-lo.
Existem pequenos benefícios que você pode obter além dos baseados em desempenho se você particionar a unidade. Por exemplo, você poderia criptografar sua unidade "Documentos", mas ainda assim deixar as partições de música e vídeo abertas. Além disso, o NTFS permite a compactação da unidade para economizar espaço em disco, mas isso pode prejudicar o desempenho, então talvez você não queira que seus "Vídeos" sejam compactados porque eles também não serão transmitidos, mas talvez a partição "Music" seja muito boa música no seu mp3 player. Todos esses recursos podem ser feitos no nível da pasta também, mas fazê-los no nível da unidade realmente ajuda a garantir que seja sempre assim.
Se você particionar sua unidade, eu sugeriria criar o que é chamado e a "partição estendida" em toda a unidade. A razão para isto é que você só pode colocar 4 partições primárias (nativas) em uma unidade, ao passo que se você criar uma "partição estendida" primeiro, você pode fazer quantas partições "lógicas" quiser depois disso!
Uma última coisa, se você particionar tudo, apenas esteja ciente de que se você acabar preenchendo uma partição completamente cheia (digamos, a partição de vídeos), você pode ter um momento de redimensionar as outras partições para fazer espaço para mais espaço na partição de vídeo. Também é perigoso também. Eu tive o redimensionamento da partição e os movimentos falharam no meio do caminho. Isso deixou todos os meus dados em uma partição que não foi declarada, ou no lugar certo ... o que torna a recuperação de tudo muito mais complicada e improvável. Por isso, SEMPRE faça backup de seus dados em algum outro lugar antes de mexer nas partições que possuem dados nelas.