Acabei de descobrir algo que perdi - o item de menu "Preferências". Eu passei pelas configurações para as VMs individuais muitas vezes, mas não percebi que havia um menu "Preferências" separado por algum motivo. Eu abri isso, e eis que, havia uma caixa de seleção em "Input" (onde a chave do host está definida, outra coisa que eu estava pensando) chamado "Auto Capture Keyboard". Isso não foi verificado, por algum motivo, e verificar isso fez com que se comportasse como antes.
Seria bom se isso fosse definido por VM, mas a boa notícia é que ele pode ser alterado enquanto a VM está em execução e entra em vigor imediatamente. Então, problema resolvido. O usuário é um idiota. : (