Um BSOD do Windows não pode causar um setor defeituoso, se por isso você quer dizer um setor que será lido mais tarde como "Erro ECC Incorrigível" ou similar. Isso ocorre porque o software não tem acesso a nada em nenhum nível inferior ao conector da unidade, e normalmente não há nada que possa ser feito na interface de uma unidade de disco que funcione corretamente e que pode causar um setor defeituoso. Não no Windows.
Eu digo "ordinariamente", "não sob o Windows" porque o utilitário hdparm do Unix-y tem uma opção - make-bad-sector. Ele funciona invocando os comandos WRITE_LONG ou WRITE_UNCORRECTABLE_EXT ATA. Mas os drivers de disco do Windows (estamos falando sobre o Windows, já que você está falando sobre um BSOD) não fornecem nenhuma maneira de solicitar essas funções.
Você provavelmente tem um disco rígido com falha. Você tinha um setor ruim (que você conhecia), mas desde então ele desenvolveu outro. Isso não é incomum. Os erros subseqüentes podem ou não ter causado o BSOD. Eu posso imaginar vários erros HD que poderiam levar a um BSOD, provavelmente devido a falha para resolver uma falha de página que foi levantada no modo kernel (código BSOD KERNEL_INPAGE_ERROR).
Incidentalmente, um BSOD não pode ser causado por um aplicativo de terceiros . Apenas pelo código do modo kernel com bugs (como um driver), um bug em um processo de sistema protegido ou falha de hardware. Bugs em aplicativos só podem causar falhas de aplicativos. E as BSODs não são "comuns" em hardware funcionando corretamente com drivers confiáveis.