Eu sempre vejo os arquivos como anexos. Acabei de fazer um teste rápido com um arquivo de texto simples e ele é exibido como um anexo conforme o esperado. Talvez tenha a ver com a maneira como o arquivo é anexado pelo cliente de email de envio?
Se você der uma olhada na fonte bruta (Command-Option-U), poderá ver alguns detalhes sobre como o anexo está incluído na mensagem. Se o Content-Disposition disser inline, é correto que o Mail exiba o anexo na mensagem conforme você descreve. Se o Content-Disposition diz anexo, ele deve aparecer como um arquivo separado.
Veja como foi o meu teste.
--Apple-Mail-5--439805500
Content-Type: text/plain;
charset=US-ASCII;
format=flowed
Content-Transfer-Encoding: 7bit
Hi Pete, I've attached the file.
--Apple-Mail-5--439805500
Content-Disposition: attachment;
filename=attachment.txt
Content-Type: text/plain;
x-unix-mode=0644;
name="attachment.txt"
Content-Transfer-Encoding: 7bit
This is the contents of attachment.txt!!!1one
--Apple-Mail-5--439805500
Content-Type: text/plain;
charset=US-ASCII;
format=flowed
Content-Transfer-Encoding: 7bit
--Apple-Mail-5--439805500--